KEGG   ORTHOLOGY: K16497
Entry
K16497                      KO                                     
Symbol
PCDHGC
Name
protocadherin gamma subfamily C
Disease
H02461  Neurodevelopmental disorder with microcephaly
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04515 Cell adhesion molecules
    K16497  PCDHGC; protocadherin gamma subfamily C
Cell adhesion molecules [BR:ko04515]
 Cadherins
  Protocadherins
   K16497  PCDHGC; protocadherin gamma subfamily C
Genes
HSA: 5098(PCDHGC3) 56097(PCDHGC5) 56098(PCDHGC4)
PTR: 100034695(PCDHGC3) 100034696(PCDHGC4) 100034697(PCDHGC5) 112207910
PON: 100171758(PCDHGC5) 112133364(PCDHGC4)
HMH: 116471632
MCC: 114678919(PCDHGC5) 114678922(PCDHGC4) 114678923(PCDHGC3)
MNI: 105466995 112424092(PCDHGC5) 112424093(PCDHGC4)
TGE: 112626416
MLEU: 105534900
PTEH: 111526968
CANG: 105510088(PCDHGC5) 105510089(PCDHGC4) 105510090(PCDHGC3)
SBQ: 101029820
CIMI: 108307063
CSYR: 103269876
LCAT: 123637896
PCOQ: 105811562
OGA: 100943920
MMU: 93706(Pcdhgc3) 93707(Pcdhgc4) 93708(Pcdhgc5)
MCAL: 110284891
RNO: 116782(Pcdhgc3) 641525(Pcdhgc5)
MCOC: 116087063
ANU: 117719689
MUN: 110557101
CGE: 100753238 100753539(Pcdhgc4)
MAUA: 101832181
PROB: 127234245
PLEU: 114687128(Pcdhgc3)
MORG: 121453419
MFOT: 126491964
AAMP: 119814114 119814291(Pcdhgc4)
NGI: 103736114(Pcdhga12)
CCAN: 109681343 109681344(Pcdhgc5)
DORD: 105988606 105988673(Pcdhgc5) 105988674(Pcdhgc4)
DSP: 122118088
PLOP: 125339773
NCAR: 124986722
MMMA: 107142049
OPI: 101525908(PCDHGC5) 101529195(PCDHGC3) 105941897(PCDHGC4)
NPO: 129513664(PCDHGC4)
AML: 100466380
UAH: 113255376 113255377
ELK: 111156924 111156925
MNP: 132028603
MLK: 131832177
NVS: 122890074
ORO: 101368324 101368804
EJU: 114200660
MLX: 118016735
NSU: 110590965
LWW: 102738963
PCOO: 112860613(PCDHGC4) 112861239(PCDHGC5) 112861489(PCDHGC3)
LRUF: 124516236 124516700
PUC: 125934883 125934884
AJU: 106967305
BOM: 102267002(PCDHGC4)
BBUB: 102390875
BBIS: 104996231(PCDHGC5)
CHX: 102191519
OAS: 101105495
BTAX: 128050922 128050923 128050924(PCDHGC5)
ODA: 120863539
MBEZ: 129558482 129558483(PCDHGC5)
CFR: 102508199
VPC: 102540146
BMUS: 118893074
LVE: 103081185(PCDHGC5)
OOR: 105748547
DLE: 111183016
PCAD: 102983402
NASI: 112404341(PCDHGC4)
ECB: 106781642 106781643
EAI: 123290138 123290139
MYD: 102757680(PCDHGA12)
MMYO: 118657761
MLF: 102437860
EFUS: 103285685 129149496
MNA: 107531483
DRO: 112318008(PCDHGC5) 112318009 112318166(PCDHGC4)
PDIC: 114509216
PHAS: 123807960
MMF: 118616167
HAI: 109393460
RFQ: 117016578
MJV: 108392751
SARA: 101546902(PCDHGC5) 101550512(PCDHGC4) 101550772
LAV: 100656652 111751114(PCDHGC5)
TMU: 101354188
ETF: 101662381 101662702(PCDHGC5) 105979154
MDO: 100027763(PCDHGC3)
GAS: 123236599(PCDHGC4) 123237545
SHR: 100926346
AFZ: 127550032
GGA: 408051(PCDHGC3)
MGP: 100544252
CJO: 107320284(PCDHGC3)
TPAI: 128081397
LMUT: 125700302
NMEL: 110405520
ACYG: 106034313
AFUL: 116494755
PMOA: 120499183
GFR: 102038436(PCDHGC5) 106632116
PHI: 102107921(PCDHGC3)
PMAJ: 107210569
CCAE: 111922492 111944765
ETL: 114068935
ZAB: 102068481
ACHL: 103801266(PCDHGC3) 103806658
SVG: 106861309
HRT: 120759063 120759068
FPG: 101916973
FCH: 102054548
CLV: 102091799(PCDHGC3)
NNI: 104016577 104016579
PCRI: 104029855 104038479
PLET: 104624819 104625825
EHS: 104507616 104508576
PCAO: 104045276 104048657
ACUN: 113485102(PCDHGC3)
TALA: 104363282
PADL: 103921969
AFOR: 103898304
HALD: 104313154 104323716
CCRI: 104163242
CSTI: 104554022(PCDHGC3) 104563561
CMAC: 104480979 104481573
MUI: 104537872 104540543
BREG: 104636655
FGA: 104072698 104075270
GSTE: 104255688 104260654
LDI: 104347425 104351039(PCDHGC3)
MNB: 103769526 103778576
NNT: 104403498 104408255(PCDHGC3)
DPUB: 104299839
PGUU: 104466940 104471195
ACAR: 104520672 104525185
CPEA: 104392055
AVIT: 104279013 104279657
TEO: 104379634 104384544
BRHI: 104495382 104496313
AAM: 106488064(PCDHGC3)
AROW: 112960881(PCDHGC3)
TGT: 104574976
DNE: 112981804
SCAM: 104154015 104154064(PCDHGC3)
ASN: 102386556 112548361
AMJ: 102574276(PCDHGC3)
CPOO: 109309841 109309915
GGN: 109289795 109290179
CMY: 102931528
MRV: 120370179
ACS: 100562425
PVT: 110082016
PBI: 103056622
PMUR: 107299197 107299218
TSR: 106552517
PGUT: 117656325
APRI: 131194046(PCDHGC5)
VKO: 123029666
PMUA: 114601412(PCDHGC3)
GJA: 107110353(PCDHGC3)
EMC: 129333226
XLA: 108710890 108712501 108713301 379294(pcdhga3.L)
XTR: 105946857 108646236 108646238 779824(pcdhga11)
NPR: 108785721 108785723 108785726 108785727 108785742
RTEM: 120932487 120932495 120932497
BBUF: 120986755 120986756 120986758 121008577 121008664 121008669 121008687 121008696 121008727 121008736 121008922
BGAR: 122928287 122928290 122928292 122928294 122928300 122928842
GSH: 117351816(PCDHGC3)
DRE: 100003438(pcdh1g33) 103911742 108191476(pcdh1g22) 503571(pcdh1gc5) 503572(pcdh1gc6) 554012(pcdh1g26) 554013(pcdh1g29) 554014(pcdh1g30) 554015(pcdh1g31) 554016(pcdh1g32)
SRX: 107720701 107742370 107742377 107747090 107754493
SANH: 107655666 107660889 107677964 107677983 107687322
SGH: 107552066 107552070 107586138 107586141 107588303 107596350
CCAR: 109063129 109063130 109079679 109086836 109097563 109108556
CAUA: 113054233 113109734 113109735
CGIB: 127971206 128021266 128027743
PTET: 122353122
LROH: 127171684(pcdh1g32) 127171685 127171689 127175971
RKG: 130082924 130082928 130082929 130082931 130082932(pcdh1g22)
MAMB: 125259562 125259727 125259741 125259748 125259825
MASI: 127413200 127418074 127433010 127433159 127433161
TDW: 130437735
MANU: 129447074(pcdh1g31) 129447075
IPU: 108274931 108276785 108276800 128635186 128635188
IFU: 128620534 128620535 128620537 128620538 128620540
PHYP: 113524154 113524163 113529575
SMEO: 124392413 124393322
TFD: 113650306 113650309 113650310 113660142
TVC: 132856721 132862894 132862903 132863165 132863637
AMEX: 107197946 111188173 111195029
CMAO: 118811457 118811477 118824489 118824493 118824495 118824986(pcdh1g22)
EEE: 113577132 113588740
CHAR: 105902356 105905983
TFS: 130531670 130531679 130531716 130531876
LCO: 104930405
NCC: 104945675(pcdhgc5)
TBEN: 117485400 117485402 117485450
CGOB: 115014753 115014756 115015025 115015026
PGEO: 117453596 117453601 117453606 117453608 117453892
GACU: 117555816 117555827
EMAC: 134859890 134860076
ELY: 117261140 117261141 117261142 117261149 117261150
EFO: 125894246
SLUC: 116052446 116052447 116052450 116052538 118495394
ECRA: 117952263
ESP: 116696667 116696669 116696671 116697276
PFLV: 114562568 114563243 114563244 114563247
GAT: 120818132 120818134 120818135 120818136
PPUG: 119210844 119210845
AFB: 129089894 129089897 129090505(pcdh1g22) 129090506 129090508
CLUM: 117737728 117737745
PSWI: 130209877 130209881 130210074
MSAM: 119881896 119881897 119889232 119889236 119889241 119889243 119889322
SCHU: 122880002 122880006 122880009 122880019
CUD: 121516121(pcdh1g22) 121516303
ALAT: 119007663 119007669(pcdh1g22) 119007671 119007675
ONL: 100711027 102079302 102079397 112842395
OAU: 116319445 116321733 116321917 120442260
OLA: 101169865 101173604 111947991 111947994 111947997 111947999
OML: 112138802 112138803 112153685 118599223 118599224
CSAI: 133446996 133447000(pcdh1g22) 133447737
XMA: 102220311 102220576 102232233 102235430
XCO: 114138954 114138956 114138957
XHE: 116714974 116714975 116714980
PRET: 103471331
PFOR: 103147442 103147443 103147515
PLAI: 106950266 106950268 106950269 106950270 106950272
PMEI: 106924627 106924628 106924630 106924631 106924632 106924633 106924634
GAF: 122836611 122836616(pcdh1g22) 122836617 122837426 122837427 122837428
PPRL: 129362980 129362990 129362991 129362997(pcdh1g22)
CVG: 107097624 107097626
CTUL: 119776979 119776980 119776981 119776982 119776983
GMU: 124860215 124860216 124860217 124860222 124860224(pcdh1g22) 124860735
NFU: 107376386 107376445 107376455
KMR: 108243066 108243068 112450953 112450954
ALIM: 106516803
NWH: 119408466 119408700
AOCE: 111576750 111576751 111576752 111576782 111576784 111576791
MCEP: 125008080 125008086(pcdh1g22) 125008092 125008093
CSEM: 103390860 107989585
POV: 109636284 109648067
SSEN: 122778036 122778183 122778588 122778589 122778590
HHIP: 117768880 117768884 117768886 117768887 117768890 117768891
HSP: 118111996 118112004 118112010 118112011
SMAU: 118319082 124850544(pcdh1g22)
LCF: 108885477 108894510 108894511 108894512 108894514
SDU: 111232396 111232398 111232399 111232400 111232401 111232547 111232548 111232549 111232550 111232551
SLAL: 111662763 111662801 111662803 111662804
XGL: 120785181 120785641 120785642 120785775 120785779 120785780
HCQ: 109524209 109524249 109524251 109524252
SBIA: 133508978
PTAO: 133485290
BPEC: 110161337 110162240 110162242 110162244 110162336
MALB: 109955936 109957489
BSPL: 114864338 114864344 114864345 114864347 114864374 129604700
SJO: 128362568 128362569 128362571 128362573 128363459 128363460 128363461 128363462
SASA: 106568128 106568129 106568130 106594404 106594405 106603223 106603224 106603244 106603245 106603246 106603249 106604876 106604879 106611833 106611851
STRU: 115154610 115154611 115154613 115154615 115163800 115173703 115173792 115205349
OTW: 112220802 112220803 112220809 112242181 121846918
OMY: 110488672 110488686 110504858 110504887 110533901
OGO: 124008017
ONE: 115126280 115126282 115126283 115135691 115136304
OKI: 109864681 109878407 116355092 116355093 116355095
OKE: 118370750 118370751 118372128 118381495 118389700
SALP: 111950144 111950148 111965428 111982133 112070488
SNH: 120043234 120043250 120043266 120047970 120047987 120048016 120048041 120048066 120048099 120048177 120056711 120056712 120056713 120056714 120056715 120056716 120056718 120061850 120062308 120062593
CCLU: 121532793 121543844 121573779 121579882
ELS: 105024623 106024272 114839494 114839523
SFM: 108925239 108925318 108934196 114912122
PKI: 111859887
AANG: 118223390
LOC: 102689599
PSPA: 121296790 121312585
ARUT: 117431573 117962297
 » show all
Reference
PMID:10380929
  Authors
Wu Q, Maniatis T
  Title
A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes.
  Journal
Cell 97:779-90 (1999)
DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
  Sequence
[hsa:5098 56098 56097]
Reference
PMID:10817752
  Authors
Yagi T, Takeichi M.
  Title
Cadherin superfamily genes: functions, genomic organization, and neurologic diversity.
  Journal
Genes Dev 14:1169-80 (2000)
DOI:10.1101/gad.14.10.1169
  Sequence
[hsa:56097 56098 5098]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system