KEGG   ORTHOLOGY: K12836
Entry
K12836                      KO                                     

Name
U2AF1
Definition
splicing factor U2AF 35 kDa subunit
Pathway
ko03040  Spliceosome
ko05131  Shigellosis
Disease
H01481  Myelodysplastic syndrome
H02410  Myelodysplastic/myeloproliferative neoplasms
H02411  Chronic myelomonocytic leukemia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12836  U2AF1; splicing factor U2AF 35 kDa subunit
 09160 Human Diseases
  09171 Infectious disease: bacterial
   05131 Shigellosis
    K12836  U2AF1; splicing factor U2AF 35 kDa subunit
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K12836  U2AF1; splicing factor U2AF 35 kDa subunit
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex A
  U2 snRNP components
   U2 related factors
    K12836  U2AF1; splicing factor U2AF 35 kDa subunit
 Complex B
  U2 snRNP components
   U2 related factors
    K12836  U2AF1; splicing factor U2AF 35 kDa subunit
Genes
HSA: 102724594(U2AF1L5) 199746(U2AF1L4) 7307(U2AF1)
PTR: 107972536(U2AF1) 455961(U2AF1L4) 748339
PPS: 100967896(U2AF1L4) 100973922(U2AF1) 100989702
GGO: 101152157(U2AF1L4) 109025442(U2AF1)
PON: 100442368(U2AF1L4) 100459870
NLE: 100579477(U2AF1L4) 100598318(U2AF1)
MCC: 718865(U2AF1L4) 722383(U2AF1)
MCF: 102146265(U2AF1) 102147005(U2AF1L4)
CSAB: 103219520(U2AF1) 103234534(U2AF1L4)
RRO: 104667083(U2AF1L4) 104677998
RBB: 108512326(U2AF1L4) 108529601
CJC: 100407900(U2AF1L4) 100415206(U2AF1)
SBQ: 101033677(U2AF1) 101034669(U2AF1L4)
MMU: 108121(U2af1) 233073(U2af1l4)
MCAL: 110297714(U2af1l4) 110312692(U2af1)
MPAH: 110327942(U2af1l4) 110338099(U2af1)
RNO: 361542(U2af1l4) 687575(U2af1)
MUN: 110550955(U2af1l4) 110553309(U2af1) 110560522
CGE: 100766015(U2af1) 113837364
NGI: 103729339(U2af1) 103729932(U2af1l4)
HGL: 101702719(U2af1)
CCAN: 109676067(U2af1) 109689623(U2af1l4)
OCU: 100347194(U2AF1L4)
TUP: 102472869(U2AF1) 102475415 102475692(U2AF1L4) 102487147
CFA: 476480(U2AF1L4) 478422(U2AF1)
VVP: 112908005(U2AF1) 112928534(U2AF1L4)
AML: 100475807(U2AF1L4) 100477945
UMR: 103680762(U2AF1) 103682515(U2AF1L4)
UAH: 113244808(U2AF1L4) 113253956(U2AF1)
ORO: 101364815(U2AF1) 101382011(U2AF1L4)
FCA: 101084133(U2AF1) 101100016(U2AF1L4)
PTG: 102961835(U2AF1L4) 102966473(U2AF1)
PPAD: 109251487(U2AF1L4) 109256934(U2AF1)
AJU: 106974696(U2AF1L4) 106985646(U2AF1)
BTA: 512680(U2AF1) 615198(U2AF1L4)
BOM: 102277165(U2AF1L4) 102285962(U2AF1)
BIU: 109560716(U2AF1) 109572381(U2AF1L4)
BBUB: 102390222(U2AF1) 102411890(U2AF1L4)
CHX: 102177830(U2AF1L4) 102185316(U2AF1)
OAS: 101120185(U2AF1L4) 101122249(U2AF1)
SSC: 100518557(U2AF1L4) 110256499(U2AF1)
CFR: 102506812(U2AF1L4) 102507415 102520320 102520476(U2AF1)
CDK: 105088054(U2AF1L4) 105097176 105100828 105105913(U2AF1)
BACU: 103016815(U2AF1L4) 103018080(U2AF1)
LVE: 103074199(U2AF1L4) 103082740(U2AF1)
OOR: 101281632(U2AF1) 101285048
DLE: 111163808(U2AF1) 111181200(U2AF1L4)
PCAD: 102982961(U2AF1) 102987253(U2AF1L4) 114483864
ECB: 100051464(U2AF1L4) 100057570(U2AF1)
EPZ: 103543387 103566082(U2AF1L4)
EAI: 106829251(U2AF1L4) 106829924(U2AF1)
MYD: 102765255(U2AF1) 102771842
MNA: 107541252(U2AF1)
HAI: 109395198(U2AF1)
DRO: 112306154(U2AF1)
PALE: 102882323(U2AF1) 102898062(U2AF1L4)
RAY: 107497628(U2AF1L4) 107510191(U2AF1)
MJV: 108392425(U2AF1) 108401522(U2AF1L4)
LAV: 100656063(U2AF1L4) 100671126(U2AF1)
MDO: 100013476(U2AF1L4) 100014534(U2AF1)
SHR: 100933719(U2AF1)
PCW: 110199144(U2AF1) 110201784(U2AF1L4)
OAA: 100080963(U2AF1) 100082198(U2AF1L4)
GGA: 395370(U2AF1)
MGP: 100551194(U2AF1)
CJO: 107323922(U2AF1)
NMEL: 110403482(U2AF1)
APLA: 101798318(U2AF1)
ACYG: 106036082(U2AF1)
TGU: 100190246(U2AF1)
LSR: 110479442(U2AF1)
SCAN: 103815753(U2AF1)
GFR: 102033627(U2AF1)
FAB: 101819787(U2AF1)
PHI: 102107120(U2AF1)
PMAJ: 107208895(U2AF1)
CCAE: 111927483(U2AF1)
CCW: 104686256(U2AF1)
ETL: 114069240(U2AF1)
FPG: 101911367(CBS)
FCH: 102052541(U2AF1)
CLV: 102086286(U2AF1)
EGZ: 104128265(U2AF1)
NNI: 104020848(U2AF1)
ACUN: 113477410(U2AF1)
PADL: 103920302(U2AF1)
AAM: 106483675(U2AF1)
ASN: 102380119(U2AF1)
AMJ: 102560222(U2AF1)
PSS: 102455938(U2AF1) 102457751
CMY: 102932393(U2AF1L4) 102932449(U2AF1)
CPIC: 101930981(U2AF1) 101950849(U2AF1L4)
ACS: 100555919(u2af1)
PVT: 110074068(U2AF1)
PBI: 103055544
PMUR: 107295080
TSR: 106542860
PMUA: 114596127(U2AF1)
GJA: 107109221(U2AF1)
XLA: 108707789(u2af1.L) 734926(u2af1.S)
XTR: 733934(u2af1)
NPR: 108803214
DRE: 192328(u2af1)
IPU: 108259017(u2af1)
PHYP: 113537627(u2af1)
AMEX: 103046898
SALP: 111959490
ELS: 105031002(u2af1)
SFM: 108920077 108933063(u2af1)
PKI: 111852817(u2af1)
LCM: 102364147(U2AF1)
CMK: 103188728(u2af1)
RTP: 109938458
BFO: 118416058
CIN: 100170074(zf(c3h)-16)
APLC: 110989454
SKO: 100379048
DME: Dmel_CG3582(U2af38)
DER: 6543395
DSE: 6617235
DSI: Dsimw501_GD22967(Dsim_GD22967)
DAN: 6507521
DSR: 110178141
DPE: 6593762
DMN: 108163798
DWI: 6642767
DAZ: 108609756
DNV: 108650005
DHE: 111602470
DVI: 6628636
MDE: 101899544
LCQ: 111678408
AAG: 5568279
AME: 413842
BIM: 100744861
BTER: 100648530
CCAL: 108629932
OBB: 114874827
NVI: 100113925
CSOL: 105367422
TCA: 657904
DPA: 109539736
NVL: 108566781
BMOR: 101742886
BMAN: 114246097
PMAC: 106714112
PRAP: 111001129
HAW: 110384366
TNL: 113497345
PXY: 105391708
API: 100160005
DNX: 107165234
AGS: 114122737
RMD: 113553167
BTAB: 109036586
CLEC: 106672466
ZNE: 110840956
FCD: 110846960
TUT: 107367829
CSCU: 111618911
PTEP: 107449562
CEL: CELE_Y116A8C.35(uaf-2)
CBR: CBG00419(Cbr-uaf-2)
TSP: Tsp_06813
PCAN: 112569015
CRG: 105320956
MYI: 110462120
OBI: 106871304
SHX: MS3_00812
NVE: 5509949
EPA: 110251195
ADF: 107358392
AMIL: 114953907
PDAM: 113676612
SPIS: 111329880
DGT: 114524904
HMG: 100207704
ATH: AT1G27650(ATU2AF35A) AT3G44785 AT5G42820(U2AF35B)
RSZ: 108818809
LJA: Lj0g3v0004639.1(Lj0g3v0004639.1) Lj0g3v0180079.1(Lj0g3v0180079.1) Lj1g3v4694450.1(Lj1g3v4694450.1) Lj3g3v1132330.1(Lj3g3v1132330.1) Lj3g3v1132330.2(Lj3g3v1132330.2) Lj3g3v1132330.3(Lj3g3v1132330.3) Lj3g3v3006550.1(Lj3g3v3006550.1)
DOSA: Os01t0667800-01(Os01g0667800) Os05t0564200-01(Os05g0564200) Os09t0491756-01(Os09g0491756)
ATS: 109767752(LOC109767752) 109771533(LOC109771533) 109773716(LOC109773716)
MNG: MNEG_3587
APRO: F751_1544
ERC: Ecym_8150
TPF: TPHA_0C04920(TPHA0C04920)
TBL: TBLA_0G03640(TBLA0G03640)
TDL: TDEL_0B00390(TDEL0B00390)
PIC: PICST_38818(UTAF1)
CAL: CAALFM_C104990CA(CaO19.53) CAALFM_C105090WA(TRY2)
NCR: NCU03261
NTE: NEUTE1DRAFT133187(NEUTE1DRAFT_133187)
MGR: MGG_09948
SSCK: SPSK_05561
MAW: MAC_00999
MAJ: MAA_05734
CMT: CCM_02320
MBE: MBM_06195
ANI: AN9362.2
ANG: ANI_1_128014(An01g01060)
ABE: ARB_00253
TVE: TRV_07874
PTE: PTT_18947
CNE: CNI01460
CNB: CNBH1370
TASA: A1Q1_06149
ABP: AGABI1DRAFT71717(AGABI1DRAFT_71717)
ABV: AGABI2DRAFT221673(AGABI2DRAFT_221673)
MGL: MGL_1664
MRT: MRET_0760
DDI: DDB_G0285077(u2af1)
DFA: DFA_05633(u2af1)
EHI: EHI_016140(13.t00007) EHI_156380(100.t00020) EHI_192500(69.t00024)
PCB: PCHAS_091550(PC000853.02.0)
TAN: TA03790
TPV: TP03_0294
BBO: BBOV_IV007810(23.m06352)
CPV: cgd8_5240
SMIN: v1.2.006228.t1(symbB.v1.2.006228.t1) v1.2.011028.t1(symbB.v1.2.011028.t1)
NGD: NGA_0191100(U2AF1)
SPAR: SPRG_07523
 » show all
Reference
PMID:8647433
  Authors
Zuo P, Maniatis T
  Title
The splicing factor U2AF35 mediates critical protein-protein interactions in constitutive and enhancer-dependent splicing.
  Journal
Genes Dev 10:1356-68 (1996)
DOI:10.1101/gad.10.11.1356
  Sequence
[hsa:7307]
Reference
  Authors
Huang T, Vilardell J, Query CC
  Title
Pre-spliceosome formation in S.pombe requires a stable complex of SF1-U2AF(59)-U2AF(23).
  Journal
EMBO J 21:5516-26 (2002)
DOI:10.1093/emboj/cdf555
  Sequence
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system