KEGG   ORTHOLOGY: K10610
Entry
K10610                      KO                                     

Name
DDB1
Definition
DNA damage-binding protein 1
Pathway
ko03420  Nucleotide excision repair
ko04120  Ubiquitin mediated proteolysis
ko05161  Hepatitis B
ko05170  Human immunodeficiency virus 1 infection
ko05203  Viral carcinogenesis
Disease
H00403  Disorders of nucleotide excision repair
H01428  Xeroderma pigmentosum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   04120 Ubiquitin mediated proteolysis
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05203 Viral carcinogenesis
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
  09172 Infectious disease: viral
   05170 Human immunodeficiency virus 1 infection
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
   05161 Hepatitis B
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
Ubiquitin system [BR:ko04121]
 Ubiquitin ligases (E3)
  Multi subunit Ring-finger type E3
   Cul4 complex
    Adoptor protein
     K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     Cul4-DDB2 complex
      K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
    TCR (transcription coupled repair) factors
     Cul4-CSA complex
      K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
Genes
HSA: 1642(DDB1)
PTR: 451234(DDB1)
PPS: 100974073(DDB1)
GGO: 101128174(DDB1)
PON: 100173610(DDB1)
NLE: 100591012(DDB1)
MCC: 694253(DDB1)
MCF: 102139788(DDB1)
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RNO: 64470(Ddb1)
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PTI: PHATRDRAFT_29502(DDB1)
FCY: FRACYDRAFT_135945(DDB1_1)
SPAR: SPRG_04038
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Reference
  Authors
Wang H, Zhai L, Xu J, Joo HY, Jackson S, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Xiong Y, Zhang Y
  Title
Histone H3 and H4 ubiquitylation by the CUL4-DDB-ROC1 ubiquitin ligase facilitates cellular response to DNA damage.
  Journal
Mol Cell 22:383-94 (2006)
DOI:10.1016/j.molcel.2006.03.035
  Sequence
[hsa:1642]
Reference
  Authors
Lovejoy CA, Lock K, Yenamandra A, Cortez D
  Title
DDB1 maintains genome integrity through regulation of Cdt1.
  Journal
Mol Cell Biol 26:7977-90 (2006)
DOI:10.1128/MCB.00819-06
  Sequence
[hsa:1642]
Reference
  Authors
Higa LA, Wu M, Ye T, Kobayashi R, Sun H, Zhang H
  Title
CUL4-DDB1 ubiquitin ligase interacts with multiple WD40-repeat proteins and regulates histone methylation.
  Journal
Nat Cell Biol 8:1277-83 (2006)
DOI:10.1038/ncb1490
  Sequence
[hsa:1642]
Reference
PMID:8530102
  Authors
Dualan R, Brody T, Keeney S, Nichols AF, Admon A, Linn S
  Title
Chromosomal localization and cDNA cloning of the genes (DDB1 and DDB2) for the p127 and p48 subunits of a human damage-specific DNA binding protein.
  Journal
Genomics 29:62-9 (1995)
DOI:10.1006/geno.1995.1215
  Sequence
[hsa:1642]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system