KEGG   ORTHOLOGY: K14326
Entry
K14326                      KO                                     
Symbol
UPF1, RENT1
Name
regulator of nonsense transcripts 1 [EC:5.6.2.5 5.6.2.3]
Pathway
map03013  Nucleocytoplasmic transport
map03015  mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 Nucleocytoplasmic transport
    K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.3  DNA 5'-3' helicase
     K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
    5.6.2.5  RNA 5'-3' helicase
     K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Surveillance factors
    Surveillance complex
     K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
Other DBs
COG: COG1112
GO: 0032574 0043139
Genes
HSA: 5976(UPF1)
PTR: 456373(UPF1)
PPS: 100967567(UPF1)
GGO: 101152393(UPF1)
PON: 103893082(UPF1)
PPYG: 129020531(UPF1)
NLE: 100582659(UPF1)
HMH: 116478720(UPF1)
SSYN: 129459232(UPF1)
MCC: 720288(UPF1)
MCF: 101866172(UPF1)
MTHB: 126942181
MNI: 105485314(UPF1)
CSAB: 103234195(UPF1)
CATY: 105601715(UPF1)
PANU: 101025274(UPF1)
TGE: 112612427(UPF1)
MLEU: 105547111(UPF1)
RRO: 104680634(UPF1)
TFN: 117074723(UPF1)
PTEH: 111554292(UPF1)
CANG: 105500356(UPF1)
CJC: 100388434(UPF1)
CIMI: 108284566(UPF1)
ANAN: 105711027(UPF1)
CSYR: 103249421(UPF1)
MMUR: 105855003(UPF1)
LCAT: 123638487(UPF1)
ERUF: 138388541(UPF1)
PCOQ: 105818136(UPF1)
OGA: 100963644(UPF1)
MMU: 19704(Upf1)
MCAL: 110299629(Upf1)
MPAH: 110336868(Upf1)
RNO: 684558(Upf1)
MCOC: 116069459(Upf1)
ANU: 117721268(Upf1)
ASYL: 127668341(Upf1)
MUN: 110549166(Upf1)
CGE: 100765798(Upf1)
MAUA: 101823609(Upf1)
PROB: 127217190(Upf1)
PLEU: 114682851(Upf1)
PMAV: 102915296(Upf1)
MORG: 121462601(Upf1)
MFOT: 126491800
AAMP: 119811108(Upf1)
NGI: 103726857(Upf1)
HGL: 101704366(Upf1)
CPOC: 100713813(Upf1)
CCAN: 109684931(Upf1)
DORD: 105994690(Upf1)
DSP: 122100816(Upf1)
DMER: 138817671(Upf1)
PLOP: 125348931(Upf1)
NCAR: 124969609
MMMA: 107145072(Upf1)
ITI: 101958125(Upf1)
OCU: 127482716
OPI: 101521752(UPF1)
OCZ: 121160510(UPF1)
TUP: 106734733(UPF1)
GVR: 103596525(UPF1)
CFA: 476664(UPF1)
CLUD: 112666765(UPF1)
VVP: 112913074(UPF1)
VLG: 121494455(UPF1)
NPO: 129521492(UPF1)
AML: 100480150(UPF1)
UMR: 103675150(UPF1)
UAH: 113256732(UPF1)
UAR: 123779845(UPF1)
ELK: 111143778
LLV: 125081913
MPUF: 101693686(UPF1)
MNP: 132011200(UPF1)
MLK: 131823780(UPF1)
NVS: 122909565(UPF1)
ORO: 101380112(UPF1)
EJU: 114196369(UPF1)
ZCA: 113916841(UPF1)
MLX: 118005640(UPF1)
NSU: 110574550(UPF1)
LWW: 102729790
FCA: 101096043(UPF1)
PYU: 121011283(UPF1)
PCOO: 112852690(UPF1)
PBG: 122487124(UPF1)
PVIV: 125160986(UPF1)
LRUF: 124523044
LGF: 123607443(UPF1)
AJU: 106969136
PTG: 102972099(UPF1)
PPAD: 109247642(UPF1)
PUC: 125929265
PLEZ: 122214206(UPF1)
HHV: 120229242(UPF1)
BTA: 532933(UPF1)
BOM: 102270024(UPF1)
BIU: 109560814(UPF1)
BBUB: 102407534(UPF1)
BBIS: 104993896(UPF1)
CHX: 102189849(UPF1)
OAS: 101107598(UPF1)
BTAX: 128050589(UPF1)
CSUM: 138085335(UPF1)
ODA: 120864270(UPF1)
CCAD: 122440770(UPF1)
MREE: 136155548(UPF1)
OVR: 110131684(UPF1)
MBEZ: 129559193(UPF1)
SSC: 100738783(UPF1)
CFR: 102511479(UPF1)
CBAI: 105082686(UPF1)
CDK: 105101912(UPF1)
VPC: 102541674(UPF1)
BACU: 103003571(UPF1)
BMUS: 118891966(UPF1)
LVE: 103082780(UPF1)
OOR: 101273793(UPF1)
LALB: 132517496(UPF1)
GMF: 115865349(UPF1)
DDP: 132422892(UPF1)
DLE: 111166517(UPF1)
PCAD: 102975873(UPF1)
PSIU: 116750962(UPF1)
PPHC: 136120527(UPF1)
NASI: 112414816(UPF1)
ECB: 100071059(UPF1)
EPZ: 103565075(UPF1)
EAI: 106846482(UPF1)
MYB: 102256312(UPF1)
MYD: 102760523(UPF1)
MMYO: 118657662(UPF1)
MLF: 102423624(UPF1)
MDT: 132234786(UPF1)
MYUM: 139011152(UPF1)
PKL: 118726056(UPF1)
EFUS: 103299528(UPF1)
MNA: 107535340(UPF1)
DRO: 112304965(UPF1)
SHON: 118975141(UPF1) 118980018
AJM: 119046853(UPF1)
PDIC: 114503146(UPF1)
PHAS: 123828222(UPF1)
MMF: 118643632(UPF1)
PPAM: 129074981(UPF1)
HAI: 109382426(UPF1)
RFQ: 117037535(UPF1)
PALE: 102884453(UPF1)
PGIG: 120606574(UPF1)
PVP: 105296581(UPF1)
RAY: 107503721(UPF1)
MJV: 108406009(UPF1)
TOD: 119241138(UPF1)
SARA: 101547354(UPF1)
SFUM: 130028517(UPF1)
SETR: 126030291(UPF1)
LAV: 100654230(UPF1)
TMU: 101361458
ETF: 101660876(UPF1)
DNM: 101430534(UPF1)
MDO: 100012828(UPF1)
GAS: 123256790(UPF1)
SHR: 100929203(UPF1)
AFZ: 127545177
PCW: 110223386(UPF1)
TVP: 118848239(UPF1)
PBRV: 138145898(UPF1)
MLAO: 141501073(UPF1)
OAA: 100078364(UPF1) 114808759
TACU: 119919839(UPF1)
GGA: 420119(UPF1)
PCOC: 116235731(UPF1)
MGP: 100548164(UPF1)
CJO: 107325348(UPF1)
TPAI: 128088866(UPF1)
LMUT: 125685126(UPF1)
NMEL: 110388864(UPF1)
APLA: 101804967(UPF1)
AACU: 137844985(UPF1)
ACYG: 106047929(UPF1)
CATA: 118259895(UPF1)
AFUL: 116499025(UPF1)
TGU: 100223354(UPF1)
LSR: 110482937(UPF1)
SCAN: 103824543(UPF1)
PMOA: 120499017(UPF1)
OTC: 121347103(UPF1)
PRUF: 121352701(UPF1)
ATRC: 139602287(UPF1)
GFR: 102035599(UPF1)
FAB: 101809945(UPF1)
OMA: 130264603(UPF1)
PHI: 102107506(UPF1)
CCAE: 111940326(UPF1)
CCW: 104697422(UPF1)
CBRC: 103625568(UPF1)
ACOE: 138099729(UPF1)
ETL: 114071350(UPF1)
ZAB: 102069976
ZLE: 135458741(UPF1)
ACHL: 103807144(UPF1)
SVG: 106859746(UPF1)
MMEA: 130585357(UPF1)
HRT: 120763421(UPF1)
SATI: 136375170(UPF1)
CFAI: 136305265(UPF1)
CCIC: 134054424(UPF1)
FPG: 101923816(UPF1)
FCH: 102058336(UPF1)
CCRI: 104162106
NNT: 104407937(UPF1)
SHAB: 115618289(UPF1)
ACUN: 113489302(UPF1)
SURA: 141935496(UPF1)
TALA: 104358164(UPF1)
ACHC: 115349572(UPF1)
HALD: 104324486(UPF1)
HLE: 104829138(UPF1)
AGEN: 126041500
HHAR: 128148624(UPF1)
BBUT: 142035638(UPF1)
GCL: 127025416
CSTI: 104556282(UPF1)
LDI: 104354831(UPF1)
MNB: 103780030(UPF1)
DPUB: 104300776(UPF1)
PPUS: 135192144(UPF1)
AVIT: 104271273(UPF1)
BRHI: 104490721(UPF1)
EGZ: 104129801(UPF1)
NNI: 104013722(UPF1)
PCRI: 104037341(UPF1)
PCAO: 104053092(UPF1)
PADL: 103923284(UPF1)
AFOR: 103899366(UPF1)
FGA: 104083066(UPF1)
CBOR: 142093917(UPF1)
GSTE: 104257186(UPF1)
CBOY: 140643591(UPF1)
MAME: 142420308(UPF1)
CLV: 102095827(UPF1)
CNIC: 135999018(UPF1)
MUI: 104533783(UPF1)
PGUU: 104466487(UPF1)
PLET: 104617839(UPF1)
EHS: 104503574(UPF1)
CMAC: 104473217(UPF1)
CUCA: 104065833(UPF1)
TEO: 104376683(UPF1)
BREG: 104642793(UPF1)
GAME: 129197385(UPF1)
OHA: 104327355(UPF1)
ACAR: 104521532(UPF1)
CPEA: 104386479(UPF1)
CVF: 104288980(UPF1)
RTD: 128900492(UPF1)
CRID: 134526503(UPF1)
LMIC: 141734080(UPF1)
AAM: 106496801(UPF1)
AROW: 112965674(UPF1)
NPD: 112946882(UPF1)
TGT: 104567881(UPF1)
DNE: 112992322(UPF1)
SCAM: 104146491(UPF1)
ASN: 102384608(UPF1)
AMJ: 102576388(UPF1)
CPOO: 109312344(UPF1)
GGN: 109294723(UPF1)
PSS: 102450038(UPF1)
CIZ: 142002302(UPF1)
CMY: 102939480(UPF1)
CCAY: 125627280(UPF1)
LKP: 140903082(UPF1)
NDS: 141977705(UPF1)
DCC: 119848185(UPF1)
CPIC: 101937566(UPF1)
TST: 117869033(UPF1)
CABI: 116826195(UPF1)
MRV: 120391551(UPF1)
ASAO: 132781122(UPF1)
PVT: 110072530(UPF1)
SUND: 121916616(UPF1)
PBI: 103068004(UPF1)
PMUR: 107282856(UPF1)
CTIG: 120298215(UPF1)
TSR: 106543970(UPF1)
PGUT: 117668601(UPF1)
PCAE: 139317210(UPF1)
APRI: 131188286(UPF1)
PTEX: 113435306(UPF1)
NSS: 113425468(UPF1)
VKO: 123036637(UPF1)
PMUA: 114588243(UPF1)
PRAF: 128405887(UPF1)
ZVI: 118086366(UPF1)
HCG: 128345306(UPF1)
GJA: 107105636(UPF1)
STOW: 125432782(UPF1)
EMC: 129330196(UPF1)
XLA: 108712392(upf1.L) 444289(upf1.S)
XTR: 100135270(upf1)
NPR: 108786383(UPF1)
RTEM: 120913284(UPF1)
ACAT: 141105990(UPF1)
PADS: 140326368(UPF1)
BBUF: 120989515(UPF1)
BGAR: 122919681(UPF1)
DTC: 141049773(UPF1)
PWL: 138267044(UPF1)
MUO: 115479545(UPF1)
GSH: 117365494(UPF1)
DRE: 406783(upf1)
SRX: 107724030 107740548
SANH: 107660376 107696277
SGH: 107552677 107596255(upf1)
CCAR: 109087597(upf1) 109090026
CAUA: 113045250 113111371 113111921
CGIB: 127938263 127950705
PTET: 122335602(upf1)
LROH: 127175766(upf1)
GRF: 141343707
OMC: 131524246(upf1)
PPRM: 120474947
RKG: 130075336(upf1)
MAMB: 125250043(upf1)
CIDE: 127522748
CERY: 137002870(upf1)
MASI: 127441438 127442678
TROS: 130554476(upf1)
TDW: 130417569(upf1)
MANU: 129443210 141351101
PDAB: 135744232(upf1)
IPU: 108280546
IFU: 128623954(upf1)
PHYP: 113533264(upf1)
SMEO: 124403085(upf1)
TFD: 113645254(upf1)
TVC: 132845364(upf1)
CGAR: 128512984(upf1)
NGRA: 132871799(upf1)
TRN: 134302594(upf1)
AMEX: 103031971(upf1)
CMAO: 118796972(upf1)
EEE: 113585957(upf1)
CHAR: 105900883 105907049(upf1)
SPIL: 134066876(upf1) 134102697
ASAD: 121711904(upf1) 121724762
TRU: 101064659 101074742
TFS: 130528174 130539589
TNG: GSTEN00019303G001 GSTEN00020924G001
LCO: 104920975 104930911
NCC: 104944846(upf1) 104958147
TBEN: 117489052 117495258
CGOB: 115007528 115022798
PGEO: 117445259 117462041
GACU: 117532701 117537360(upf1)
EMAC: 134866164 134869324
ELY: 117253517 117272119
EFO: 125895465 125902186
PLEP: 121951466 121965067
SLUC: 116037409 116053040
ECRA: 117950817 117953609(upf1)
ESP: 116694879(upf1) 116698918
PFLV: 114561054 114565572
GAT: 120814111 120823658(upf1)
PPUG: 119209112 119216265(upf1)
AFB: 129094184(upf1) 129115663
CLUM: 117729136 117746916
PSWI: 130193608 130198550
CANA: 137781936 137793441
CVE: 137866595 137890743
MSAM: 119900490 119902228
SCHU: 122878114 122887222
CUD: 121511950 121520135
SPUL: 138606938 138612077
LMIX: 132967142 132978967
HTC: 141788745 141804060
ALAT: 119011156 119029139
ASTR: 137598656 137611752
MZE: 101481587 101486461
ONL: 100693655 100695574(upf1)
OAU: 116313853 116314593
OLA: 101168695(upf1)
OML: 112150587(upf1)
CSAI: 133452930 133458560(upf1)
XMA: 102235710 102238036
XCO: 114146737 114150704(upf1)
XHE: 116721258 116725133(upf1)
PRET: 103463333(upf1) 103479258
PFOR: 103131441(setx) 103143823(upf1)
PLAI: 106944920(upf1) 106962276
PMEI: 106922733(upf1) 106927375
GAF: 122839115(upf1)
PPRL: 129372360(upf1)
CVG: 107088263(upf1)
CTUL: 119794399(upf1)
GMU: 124869545 124873680
NFU: 107392833(upf1)
KMR: 108234349(upf1)
ALIM: 106532231(upf1)
NWH: 119430528(upf1)
AOCE: 111566864 111573882
EJA: 138200531 138202781
BFRE: 138623092 138625248
MCEP: 125009031 125010792
CSEM: 103394659(upf1) 103398864
POV: 109636613 109647518
SSEN: 122770534 122780615(upf1)
SSOE: 131456476 131465400(upf1)
HHIP: 117760710(upf1) 117778466
HSP: 118117885 118121549
PPLT: 128448657 128454064
SMAU: 118310784 118318172
LCF: 108883653 108902765
SDU: 111216888 111228938
SLAL: 111649927 111671095
XGL: 120790518 120798859
HCQ: 109519015(upf1)
SSCV: 125976285(upf1)
SBIA: 133503202 133511156
PEE: 133405982 133412134
PTAO: 133480315 133488654
BPEC: 110170500 110174793
ENY: 140353351 140353917
MALB: 109966845(upf1) 109969255
BSPL: 114844823 114853352
SJO: 128361558 128368952
SSCO: 133985313 133990666
TTY: 137187580 137193998
GMH: 115555808(upf1)
SASA: 106568944 106573910 106599024 106613627
STRU: 115151666 115156749 115158097 115169943
OTW: 112244604 112250731 112252121 112260316
OMY: 110492327 110508900 110524138 110530135
OGO: 123997198 123998050 124009359 124042005
ONE: 115103240 115108174 115109140 115114229
OKI: 109871959 109874537 109889114 109902372
OKE: 118388160 118394507 118401473 118402279
OMM: 135512642 135516023 135524659 135558532
OCLA: 139369666 139375947 139386867 139409061
SALP: 111952926 111956547 111975641 111979393
SNH: 120020479 120053683 120054681 120055805
SFON: 129810951 129814306 129823864 129867379
CCLU: 121533664 121535061 121580771 123491973
ELS: 105024419 105026208(upf1)
OEP: 134011092(upf1)
SFM: 108930585(upf1)
PKI: 111860382(upf1)
AANG: 118225050 118228849
AROT: 135252855 135257919
CCOG: 133126163 133128450
LOC: 102690031(upf1)
PSPA: 121300641 121301326
ARUT: 117401385 117428899
PSEX: 120537556(upf1)
LCM: 102352262(UPF1)
CMK: 103182058(upf1)
RTP: 109920046(upf1)
CPLA: 122565516(upf1)
CPUN: 140494836(upf1)
HOC: 132829155(upf1)
SCAU: 119952941(upf1)
STOZ: 140395063(upf1)
LERI: 129711087(upf1)
HAKA: 140739845(upf1)
PMRN: 116941882(UPF1)
LRJ: 133343862(UPF1)
BFO: 118409889
BBEL: 109463046
CIN: 100181729
SCLV: 120346523 120346524
CLEP: 143447366
SPU: 581723
LPIC: 129262265
LVG: 121415678 121415803
AJJ: 139979155
APLC: 110988724
ARUN: 117295449
AAMU: 139941473
AFIL: 140159249
AJC: 117110788
SKO: 100367396(UPF1)
PFLL: 139121103
DME: Dmel_CG1559(Upf1)
DER: 6551354
DSE: 6620294
DSI: Dsimw501_GD24645(Dsim_GD24645)
DYA: Dyak_GE17585
DAN: 6504263
DSR: 110181835
DPO: 6901416
DPE: 6598302
DMN: 108161369 108161504 117186255 117186256
DWI: 6648598
DGR: 6564880
DMO: Dmoj_GI14718
DAZ: 108619155
DHE: 111605317
DVI: 6633444(Upf1)
CCAT: 101455775
BOD: 106627047
BDR: 105225488
RZE: 108370843
AOQ: 129237206
ALUD: 128856891
TDA: 119671322 119672009 119672705
MDE: 101899363
SCAC: 106087550
LCQ: 111675999
LSQ: 119606047
CVJ: 135958823(Upf1)
GFS: 119637131
ECOE: 129944536
CLON: 129606568
HIS: 119653714
AGA: 1282033
ACOZ: 120961572
AARA: 120896455
AMER: 121589263
ASTE: 118517557
AMAP: 126556823
AFUN: 125765901
AMOU: 128310357
AMRS: 128707152
AALI: 118458908
ADAR: 125959755
ACOS: 131271749
AAG: 5575411
AALB: 109405747
ASUA: 134224351
CQU: CpipJ_CPIJ012300
CPII: 120425863
CBRI: 134832837
CNS: 116350687
BCOO: 119077964
LLL: 129794065
PPAP: 129798756
AME: 409839
ACER: 107995912
ALAB: 122718044
ADR: 102671633
AFLR: 100863606
BIM: 100746177
BBIF: 117213905
BVK: 117231215
BVAN: 117156587
BHUN: 126863755
BTER: 100644215
BAFF: 126918087
BPYO: 122572847
BPAS: 132907158
FVI: 122527054
CCAL: 108631268
OBB: 114879215
OLG: 117610252
MGEN: 117230002
NMEA: 116428353
CGIG: 122402561
SOC: 105199267
MPHA: 105833387
AEC: 105154333
ACEP: 105618749
ACOC: 108684127
MZT: 108723028(Upf1)
CCOA: 108775103
TCZ: 108770224
TSEP: 108753707
PBAR: 105427848
VEM: 105566938
COBS: 139108296(Upf1)
TLN: 139809075(Upf1)
HST: 105182511
DQU: 106751105
CFO: 105258992
FEX: 115246350 115246366
PMEC: 138940028(Upf1)
LHU: 105674128(Upf1)
PGC: 109856725
OBO: 105283375
PCF: 106790902
PFUC: 122514156
VPS: 122634788
VCRB: 124430372
VVE: 124954135
NVI: 100120483
CSOL: 105359351
TPRE: 106648896
LHT: 122497680
LBD: 127289276
MDL: 103577127
CGLO: 123260358
CTYP: 141534507(Upf1)
FAS: 105270435
DAM: 107047864
AGIF: 122853547 122854182
CINS: 118070792
VCAN: 122416206
CCIN: 107269553
DSM: 124413693
NPT: 124221655(Upf1)
NFB: 124184660
NLO: 107223055
NVG: 124307612
AROA: 105693367
TCA: 662109
TMOL: 138134501(Upf1)
DPA: 109539788
ESIM: 136413224(Upf1)
EFOR: 136343700(Upf1)
SOY: 115884543
RFG: 143195288(Upf1)
AGRG: 126734344
ATD: 109599631
CSET: 123314855
HAXR: 123676109
AGB: 108917235
LDC: 111503207
DVV: 114325097
NVL: 108562274
DCOR: 135800227(Upf1)
APLN: 108741800
PPYR: 116162984
OTU: 111413339
MSEX: 115440080
DPL: KGM_204565
BANY: 112056176
MJU: 123874515
NIQ: 126773124
VCD: 124534580
MCIX: 123658871
PMAC: 106718872
PXU: 106119456
BPHI: 137923269(Upf1)
PRAP: 111004464
PBX: 123706895
PNAP: 125050104
CCRC: 123698327
LSIN: 126967005
AAGE: 121734122
HAW: 110374361
HZE: 124636808
TNL: 113503603
SLIU: 111354975
OFU: 114357855
ONU: 135079317
ATRA: 106129743
GMW: 113510716
PXY: 105385411
PGW: 126370656
LGLY: 125233832
CSTB: 134748804
CFUM: 141439495
CFEL: 113366373 113366381
CCRN: 123298559
API: 100160197
ACOO: 126833722 126839544
DVT: 126895961 126896029 126899269 126903753 126904949 126904965 126904988 126905060 126908294
BTAB: 109043732
DCI: 103509590
CLEC: 106666507
HHAL: 106678887(Upf1)
NLU: 111054671
LDA: 142334345(Upf1)
HVI: 124365742
MQU: 129002764
PHU: Phum_PHUM244150
FOC: 113203815
TPAL: 117639086
ZNE: 110838082
CSEC: 111874539
PAME: 138698085(Upf1)
SGRE: 126281209 126322426
BROR: 134531416
IEL: 124167374
HAMR: 139695517(Upf1)
DPX: DAPPUDRAFT_57163
DMK: 116916925
DPZ: 124340819
AFRA: 136031406 136031486
PVM: 113820690(Upf1)
PJA: 122259224
PCHN: 125037746
PMOO: 119587201
HAME: 121857801
PCLA: 123772500 138365536
CQD: 128685482(Upf1)
PTRU: 123519356
ESN: 127003355
MNZ: 135221651
MRJ: 136843679(Upf1)
PORN: 139759599(Upf1)
HAZT: 108679865
OOT: 143025576(Upf1)
EAF: 111694883
LSM: 121123667(Upf1)
TCF: 131879192
PPOI: 119100622 119100794
ISC: 8033544
DSV: 119446759
DALB: 135898552(Upf1)
RSAN: 119377166
RMP: 119182959
OTI: 135370043
VDE: 111250092
VJA: 111265415
GOE: 100908092
TUT: 107363007
DPTE: 113789973
DFR: 124493548
CSCU: 111626836
CVS: 136969867(Upf1)
PTEP: 107441024
ABRU: 129991128
UDV: 129224105
SDM: 118202993
LPOL: 106460767 106472376
PMEO: 129589142 129592582 129592583
CEL: CELE_C05C10.2(C05C10.2) CELE_Y48G8AL.6(smg-2)
CBR: CBG_01003 CBG_08494(Cbr-smg-2) CBG_22588
CRQ: GCK72_007210
BMY: BM_BM6673(Bma-smg-2)
LOA: LOAG_03249
PVUL: 126819638
PCAN: 112554189
LSAX: 138983731
BARL: 143282162
BGT: 106061166
GAE: 121384182
HRF: 124131366
HRJ: 124263362
HASI: 137278220
HCRA: 139478847
CRG: 105331061
CANU: 128178044
CVN: 111129063 111129219
OED: 125649312
MYI: 110465593
PMAX: 117335004
AIRR: 138333544
YBA: 132556345
MCAF: 127734899
MMER: 123566306
RPHI: 132722569
DPOL: 127877722
MAEA: 128227816
OBI: 106870284
OSN: 115210320
LJP: 135472297
LAK: 106159544
SMM: Smp_061590.1
LLON: 135482740
ATEN: 116299947
MCAZ: 138038493
MFOO: 137992195
SPIS: 111321675
XEN: 124449482
HMG: 100203524
HSY: 130630645
RES: 135687024
TAD: TRIADDRAFT_54641
ATH: AT5G47010(LBA1)
ALY: 9301225
CRB: 17876346
CSAT: 104728505 104760197 104771972
EUS: EUTSA_v10000743mg
BRP: 103853766
BNA: 106378491 106400530
BOE: 106327103
RSZ: 108834485
THJ: 104798343 104806689
CPAP: 110817491
CIT: 102615436
PVY: 116138325
MINC: 123216481 123224504
TCC: 18606113
GRA: 105789325 105791976 105800298
GHI: 107886389 107890625 107896538 107919919 107933728 121215623
GAB: 108456989 108469767 108483064
HSYR: 120200005 120210011
DZI: 111276658 111289908
EGR: 104443591
RARG: 115743226
FVE: 101299192
AANS: 126793460
RCN: 112175420
PPER: 18777232
PMUM: 103328883
PAVI: 110756272
PDUL: 117627130
MDM: 103409468 103439095
MSYL: 126607523 126626597
PXB: 103933278 103959071 103961082
PCOX: 137709803 137730814
ZJU: 107409346
MNT: 21406115
CSAV: 115717118
HLP: 133778001
CSV: 101214107
CMO: 103490818
BHJ: 120090078
MCHA: 111022653
CMAX: 111498325 111500224
CMOS: 111431113 111442920
CPEP: 111784697 111810634
RCU: 8263716
MEAN: 126679917
JCU: 105636460
HBR: 110649278 110667185
MESC: 110604816
POP: 18094225 18096919
PEU: 105121627 105130970
PALZ: 118039041 118062826
PNZ: 133674280 133700355
JRE: 109011455
CILL: 122280751
AGLU: 133855033
CSAA: 142613109
TWL: 119980910 119987045 120016903
VVI: 100264343
VRI: 117930411
SIND: 105155974
OEU: 111389897
HPUM: 140894740
PHUA: 140988238
PEBU: 140812114
PTAB: 142518896 142527296
CARB: 113702809 113705369
HAN: 110930521
BHW: 143535443 143561152 143597792 143627336
ECAD: 122598019
LSV: 111898305 111901176
CCAV: 112520815
DCR: 108209079 108209116
AGRV: 141668388 141698052
CSIN: 114280955 114281134
RVL: 131307592 131333528
AEW: 130764149 130773586 130792720 130795017
DLT: 127814289
BVG: 104892888
SOE: 110781662
CQI: 110730252 110732460
ATRI: 130799172 130800913
SLAF: 141587179 141592831 141638549
MOF: 131164547
NNU: 104606417 104609870
MING: 122071237 122081843
TSS: 122664563
PSOM: 113297327 113302106
OSA: 4343292
DOSA: Os07g0495900
OBR: 102700817
OGL: 127779086
BDI: 100838876
ATS: 109763115
TDC: 119354394 119363648
TAES: 123044827 123052735 123188489
TUA: 125536926
HVG: 123426134
LPER: 127333755
LRD: 124675041
SBI: 8077469
ZMA: 100304236 100383288
MFLO: 136542341 136550185
SITA: 101755895
SVS: 117844895
PVIR: 120661408 120688597
PHAI: 112880160
PAUA: 133889918 133891999
TANG: 140767512
PDA: 103703577 103704631
EGU: 105043814 105053900
MUS: 103982451 135610805
ZOF: 121981111 121984998 122001677 122005972
DCT: 110104736 110114751
PEQ: 110022886
AOF: 109819489 109825010
MSIN: 131232513
ACAK: 137947843 137967217
NCOL: 116252323
ATR: 18448386
CJF: 131038656
CRE: CHLRE_02g092500v5
VCN: VOLCADRAFT_86581
OLU: OSTLU_443
SCE: YMR080C(NAM7)
SEUB: DI49_4170
SPAO: SPAR_M01990
AGO: AGOS_ABR022C
KLA: KLLA0_B06435g
KMX: KLMA_50219(NAM7)
LTH: KLTH0D05786g
VPO: Kpol_337p1
ZRO: ZYRO0G03740g
CGR: 2887092(GVI51_D04257)
NCS: NCAS_0A07730(NCAS0A07730)
NDI: NDAI_0H02120(NDAI0H02120)
TPF: TPHA_0C03950(TPHA0C03950)
TBL: TBLA_0B05540(TBLA0B05540)
TGB: HG536_0A04200
TDL: TDEL_0A02660(TDEL0A02660)
KAF: KAFR_0A01950(KAFR0A01950)
KNG: KNAG_0C05720(KNAG0C05720)
ZMK: HG535_0D03520
SLUD: SCDLUD_004116
DHA: DEHA2E12430g
PGU: PGUG_05712
LEL: PVL30_004562(NAM7)
LBG: 92205252(LODBEIA_P00560) 92206308(LODBEIA_P11120) 92206419(LODBEIA_P12230) 92207260(LODBEIA_P20640) 92208329(LODBEIA_P31330) 92209068(LODBEIA_P38720) 92209878(LODBEIA_P46820) 92209989(LODBEIA_P47930) 92210902(LODBEIA_P57060)
CAL: CAALFM_C500500WA(NAM7)
CTP: CTRG_05276
COT: CORT_0E06200
CDU: CD36_50510
CLU: CLUG_00841
CLUS: A9F13_10g01177
CAUR: CJI96_0001161
ASAU: 88173594(PUMCH_002529)
PPA: PAS_chr3_0657
BNN: FOA43_001114(NAM7)
BBRX: BRETT_003574
OPA: HPODL_02626
YLI: 2910959(YALI2_D00505g)
NCR: NCU04242(prd-6)
SMP: 10803729(SMAC4_07821)
PAN: PODANSg8826
PBEL: QC761_209730(NAM7)
PPSD: QC762_209730(NAM7)
PPSP: QC763_209730(NAM7)
PPSA: QC764_0087640 QC764_209730(NAM7)
CTHR: CTHT_0062910
RTHE: 98124634(VTJ83DRAFT_3595)
MGR: MGG_00976
PPEI: PpBr36_08164
PGRI: PgNI_08270
TMN: UCRPA7_1707
FGR: FGSG_09930
FPU: FPSE_03107
FVN: FVRRES_03333
FVR: FVEG_02647
FOX: FOXG_05494
FFC: NCS54_00690800
FKR: NCS57_00730800
TATV: 25778519(TrAtP1_013329)
TASP: 90967371(TrAFT101_012036)
MAW: 19245474(NAM7_2)
MAJ: MAA_05571
MBRN: 26238870(RENT1)
PCHM: VFPPC_03160
UVI: 66065376(UV8b_04598)
CMT: CCM_00512
AMUS: LMH87_000867
PTKZ: JDV02_010844(NAM7)
DCON: 63717988(DCS_05345)
VAL: VDBG_00662
VDA: VDAG_00276
CFJ: CFIO01_04504
CLUP: CLUP02_10546
CHIG: CH63R_09111
CDET: 87950302(CDEST_13802)
ELA: UCREL1_7341
PFY: PFICI_06888
SSL: SS1G_00971
BFU: BCIN_14g02530(Bcnam7)
MBE: MBM_04678
GLZ: GLAREA_10435
ANI: ANIA_00646
AFM: AFUA_1G13060
ACT: ACLA_022410
NFI: NFIA_012460
AOR: AO090012000584
ANG: An08g06050
AFV: AFLA_002303
ALUC: AKAW2_30480S AKAW2_80725A
ACHE: ACHE_30419A
APUU: APUU_11381S
PCS: N7525_002937
PDP: PDIP_26520
POU: POX_c03607
TMF: EYB26_002920
TRG: TRUGW13939_09425
CIM: CIMG_06827
CPW: 9695542(D8B26_008425)
URE: UREG_03648
ABE: ARB_06689
TVE: TRV_04033
PBL: PAAG_08666
PBN: PADG_07272
AJE: HCAG_00751
BGH: BDBG_00917
PNO: SNOG_10712
PTE: PTT_08860
PTRR: 6348208(PtrM4_085180)
ADAC: 96082701(ACET3X_002379)
ARAB: EKO05_0007783
PFJ: MYCFIDRAFT_148374
FFU: CLAFUR5_00651
CBET: CB0940_00339
BCOM: BAUCODRAFT_399389
NPA: UCRNP2_6476
TML: GSTUM_00010627001
SPO: 2542327(upf1)
SOM: SOMG_01680(upf1)
CNE: CNC02960
CNB: CNBC4250
CNG: CNAG_01807
CGI: CGB_C4410W
CDEU: CNBG_3332
CDEC: 89988016(IAS62_001241)
CTEG: 91988833(I308_101975)
CBAS: 91982025(I312_101977)
CDEP: 91089257(L203_105048)
KMG: 30166898(I203_100511)
KNE: 92181776(IAR55_004518)
KDJ: 28971567(I303_107865)
KBI: 30205845(I302_102753)
KPIN: 30175870(I206_106608)
KSH: 87959896(IL334_007766)
KER: 91104158(V865_005357)
KSN: 43587402(CI109_105259)
KBO: 90012533(L199_001546)
KEP: 91098005(L201_007336)
TASA: A1Q1_01018
CCAC: CcaHIS019_0203630(NAM7)
TVS: TRAVEDRAFT_106255
DSQ: DICSQDRAFT_48618
PCO: PHACADRAFT_28301
HIR: HETIRDRAFT_443808
ADL: AURDEDRAFT_149003
RSX: RhiXN_02355
CCI: CC1G_01067
MPR: MPER_01089 MPER_04754 MPER_10533
MRR: Moror_7746
MORE: E1B28_009253
UMA: UMAG_11428
PFP: PFL1_00560
SGRA: EX895_000467
MGL: MGL_2074
MSYM: MSY001_1146
PGR: PGTG_17974
PTRC: PtA15_17A60
PSTR: Pst134EA_030458
ECU: ECU10_1640
VNX: VNE69_09128
RIE: OCT59_021475
MBR: MONBRDRAFT_650
DDI: DDB_G0288923(upf1)
EHI: EHI_035550(17.t00041)
EDI: EDI_156120
PFA: PF3D7_1005500
PFD: PFDG_00715
PFH: PFHG_01565
PREI: PRSY57_1004900
PGAB: PGSY75_1005500
PLAG: 39741919(PADL01_1004000)
PYO: PY17X_1206900
PCB: PCHAS_1204400
PBE: PBANKA_1203700
PVV: PVVCY_1200440
PKN: PKNH_0804200
PVX: PVX_094465
PMAL: PMUG01_08021300(UPF1)
PBRS: 92370346(MKS88_002258)
PREL: PRELSG_0803300
PCOT: PCOAH_00022970
TGO: TGME49_291820
BBES: BESB_019140
TET: TTHERM_00726300
PTM: GSPATT00037251001
PTI: PHATRDRAFT_16357
PIF: PITG_18912
TBR: Tb927.5.2140
TBG: TbgDal_V3070
TCR: 511317.30
TVA: 4775578(TVAGG3_0552350)
GLA: GL50803_0013452
EHX: EMIHUDRAFT_462689
 » show all
Reference
PMID:16452507
  Authors
Kashima I, Yamashita A, Izumi N, Kataoka N, Morishita R, Hoshino S, Ohno M, Dreyfuss G, Ohno S
  Title
Binding of a novel SMG-1-Upf1-eRF1-eRF3 complex (SURF) to the exon junction complex triggers Upf1 phosphorylation and nonsense-mediated mRNA decay.
  Journal
Genes Dev 20:355-67 (2006)
DOI:10.1101/gad.1389006
  Sequence
[hsa:5976]
Reference
PMID:18066079
  Authors
Chamieh H, Ballut L, Bonneau F, Le Hir H
  Title
NMD factors UPF2 and UPF3 bridge UPF1 to the exon junction complex and stimulate its RNA helicase activity.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 15:85-93 (2008)
DOI:10.1038/nsmb1330
  Sequence
[hsa:5976]
Reference
PMID:22025558
  Authors
Jeong HJ, Kim YJ, Kim SH, Kim YH, Lee IJ, Kim YK, Shin JS
  Title
Nonsense-mediated mRNA decay factors, UPF1 and UPF3, contribute to plant defense.
  Journal
Plant Cell Physiol 52:2147-56 (2011)
DOI:10.1093/pcp/pcr144
  Sequence
[ath:AT5G47010]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system